Mas em AVI nunca tive nenhum problema com isso, apenas agora com estes MKV é que acontece isso....
Alguma razão especial?
O processo é o mesmo, ao transformares para PAL eles ficam ambos em 25FPS, umas vezes funciona, outras não. O audio AAC é o mais perigoso
provavelmente é o FAAD que insere erros ao converter para WAV, ou o Besweet, não sei
Também poderás encontrar ERROS de conversão, ou multiplex multiplex em MKVs.....em sources manhosas, cujos os autores fizeram mal o Muxing. É raro isto acontecer, é o MKV que está com BAD HEADERS
Isto resolve-se usando o MKVTOOLNIX...e basta fazer REMUX
De qualquer das formas, obterás sempre melhor audio e etc...mantendo o FPS (regiao) original
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Outra forma que se calhar até poderá funcionar, não sei, porque não experimentei
é converter o vídeo no framerate original, fazer pulldown para 25FPS e manter o audio com o framerate original